珠寶紅外光譜儀不同種屬的寶石，在其內部分子結構及化學成分會有所差異，根據各類寶石特征的紅外吸收光譜對其進行鑒定。采用紅外反射法，配上漫反射支架，直接測試樣品光滑表面，很快就可以得出該樣品的特征紅外吸收光譜。特別對于一些不透明或表面拋光較差的翡翠或者其他相似玉石，通過對譜圖的分析極易將其區分開。
珠寶紅外光譜儀與分子的結構密切相關，是研究表征分子結構的一種有效手段，與其它方法相比較，光譜由于對樣品沒有任何限制，它是*的一種重要分析工具。在分子構型和構象研究、化學化工、物理、能源、珠寶材料、鑒定和工業過程控制等多方面的分析測定中都有十分廣泛的應用。
在珠寶玉石中，廣泛用到環氧樹脂膠做充填物，紅外光譜儀可以非常準確、快捷、無損分析到環氧樹脂的存在。
通過放大檢測、常規儀器檢測、珠寶紅外光譜儀，相結合得出以下一些特征；放大觀察，從顯微鏡下觀察樣品的表面，粗糙不平滑，還是可以看到酸蝕網紋，影響其光澤較差。在燈下透光觀察，其結構松散，基底發白，綠色分布較浮，顏色分布無層次感，這是由于經過酸洗后對其結構、顏色的影響。在紫外熒光燈下觀察，長波無熒光，短波有中等強度的黃綠色熒光，一般翡翠A貨通常無熒光，如含蠟質物可見長波有藍白色熒光。
