傅里葉紅外光譜儀利用紅外光譜方法可測定分子的鍵長和鍵角，并由此推測分子的立體構型。根據所得的力常數可推知化學鍵的強弱，分子中的某些基團或化學鍵，由于分子內和分子間相互作用，有機官能團的特征頻率會由于官能團所處的化學環境不同而發生微細變化，這為研究表征分子內、分子間相互作用創造了條件。在不同化合物中所對應的譜帶波數基本上是固定的或只在小波段范圍內變化，因此許多有機官能團例如甲基、亞甲基、羰基，氰基，羥基，胺基等等在紅外光譜中都有特征吸收。
該儀器主要用于化學領域、生物領域和環境領域，受到各行各業專業人士的青睞和喜愛。除了用于某些數據分析和記錄外，他們也可以使用它。高性能使得某些預設和操作非常方便，應用于染織工業、環境科學、生物學、材料科學、高分子化學、催化、煤結構研究、石油工業、生物醫學、生物化學、藥學、無機和配位化學基礎研究、半導體材料、日用化工等研究領域。
傅里葉紅外光譜儀使用中要注意的幾個方面：
一、注意控制好實驗室內的溫濕度條件
在使用傅里葉紅外光譜儀進行測定時，可以通過一些人為的方式和措施來將實驗室里的溫度和濕度保持在更佳范圍，同時還有連接電源的時候要用穩壓裝置以及接地線，以便能夠更好的保護設備以及保證測量的準確性。同時受歡迎的傅里葉紅外光譜儀廠家建議實驗室的面積不要太大，因為這樣對于溫濕度的控制會更加容易一些。
二、注意控制實驗室內的人數
如果是用的傅里葉紅外光譜儀屬于單光朿型傅里葉紅外分光光度計，那么還要控制實驗室內的二氧化碳含量。所以一般要求傅里葉紅外光譜儀的實驗室內的人數要控制在一定的范圍內，不能太多人并且要通風換氣保持空氣新鮮釋放掉多余的二氧化碳，以免影響結果。
三、注意做干燥除濕的措施
潮濕是傅里葉紅外光譜儀的大敵，所以要想辦法避免其受潮，不用的時候就應該要把設備放在實驗室的比較干燥的位置，并且每周要兩次開機半天左右，同時還要開除濕機。尤其是在梅雨季節天氣比較潮濕更需要做好這方面的控制，同時要保證所測定的樣品本身也是干燥的，可以先放在容器中用其他設備把里面的空氣和水分一起抽調，然后再用傅里葉紅外光譜儀進行測試。
